แรงดันอากาศในห้องผ่าตัดจะแตกต่างกันไปตามความต้องการด้านความสะอาดของพื้นที่ต่างๆ (เช่น ห้องผ่าตัด ห้องเตรียมฆ่าเชื้อ ห้องแปรงฟัน ห้องดมยาสลบ และพื้นที่สะอาดโดยรอบ เป็นต้น) ห้องผ่าตัดที่มีอัตราการไหลแบบลามินาร์ต่างกันจะมีมาตรฐานความสะอาดของอากาศที่แตกต่างกัน ตัวอย่างเช่น มาตรฐานของรัฐบาลกลางสหรัฐอเมริกา 1000 คือ จำนวนอนุภาคฝุ่น ≥0.5μm ต่อลูกบาศก์ฟุตของอากาศ ≤1000 อนุภาค หรือ ≤35 อนุภาคต่อลิตรของอากาศ มาตรฐานระดับ 10,000 ห้องผ่าตัดไหลลามินาร์ คือ จำนวนอนุภาคฝุ่น ≥0.5μm ต่อลูกบาศก์ฟุตของอากาศ ≤10,000 อนุภาค หรือ ≤350 อนุภาคต่อลิตรของอากาศ เป็นต้น วัตถุประสงค์หลักของการระบายอากาศในห้องผ่าตัดคือการกำจัดก๊าซไอเสียในห้องทำงานแต่ละห้อง เพื่อให้แน่ใจว่ามีอากาศบริสุทธิ์ในปริมาณที่จำเป็นในห้องทำงานแต่ละห้อง เพื่อกำจัดฝุ่นและจุลินทรีย์ เพื่อรักษาแรงดันบวกที่จำเป็นในห้อง

มีวิธีการระบายอากาศเชิงกลสองวิธีต่อไปนี้ที่สามารถตอบสนองความต้องการการระบายอากาศของห้องผ่าตัดได้ การใช้การจ่ายอากาศเชิงกลและการระบายอากาศเชิงกลร่วมกัน: การระบายอากาศประเภทนี้สามารถควบคุมจำนวนการเปลี่ยนแปลงของอากาศ ปริมาณการแลกเปลี่ยนอากาศ และความดันภายในอาคารได้ และผลการระบายอากาศก็ดีขึ้น การใช้การจ่ายอากาศเชิงกลและการระบายอากาศตามธรรมชาติร่วมกัน การแลกเปลี่ยนอากาศและจำนวนการแลกเปลี่ยนอากาศในวิธีการระบายอากาศนี้ถูกจำกัดในระดับหนึ่ง และผลการระบายอากาศก็ไม่ดีเท่าวิธีเดิม ระดับความสะอาดของห้องผ่าตัดนั้นแตกต่างกันหลักๆ ตามจำนวนอนุภาคฝุ่นและจำนวนอนุภาคทางชีวภาพในอากาศ ปัจจุบัน มาตรฐานการจำแนกประเภทของ NASA ที่ใช้กันมากที่สุดคือมาตรฐานการฟอกอากาศบรรลุวัตถุประสงค์ของความปลอดเชื้อโดยการควบคุมความสะอาดของการไหลของอากาศฟอกอากาศที่มีแรงดันบวก

เทคโนโลยีการฟอกอากาศสามารถแบ่งออกได้เป็น 2 ประเภทตามวิธีการจ่ายอากาศที่แตกต่างกัน คือ ระบบการไหลปั่นป่วนและระบบการไหลแบบลามินาร์

(1) ระบบการไหลแบบปั่นป่วน (ลักษณะหลายทิศทาง): ช่องจ่ายอากาศและตัวกรองประสิทธิภาพสูงของระบบการไหลแบบปั่นป่วนตั้งอยู่บนเพดาน และช่องจ่ายอากาศกลับตั้งอยู่ทั้งสองด้านหรือส่วนล่างของผนัง ตัวกรองและการบำบัดอากาศค่อนข้างเรียบง่ายและการขยายตัวสะดวก ต้นทุนต่ำ แต่จำนวนการเปลี่ยนแปลงอากาศน้อย โดยทั่วไป 10-50 ครั้งต่อชั่วโมง ซึ่งมีแนวโน้มที่จะเกิดการไหลแบบวน อนุภาคมลพิษอาจแขวนลอยและหมุนเวียนในบริเวณกระแสน้ำวนในร่มเพื่อสร้างการไหลของอากาศที่ปนเปื้อนและลดการฟอกอากาศในร่ม ใช้ได้เฉพาะกับห้องสะอาดในระดับ 10,000 ถึง 1,000,000 ตามมาตรฐาน NASA เท่านั้น

(2) ระบบไหลลามินัล :ระบบการไหลแบบลามินัลใช้การไหลของอากาศที่มีการกระจายสม่ำเสมอและอัตราการไหลที่เหมาะสมเพื่อนำอนุภาคและฝุ่นละอองออกจากห้องผ่าตัดผ่านทางช่องระบายอากาศกลับ โดยไม่ก่อให้เกิดกระแสน้ำวน ดังนั้นจึงไม่มีฝุ่นละอองลอยตัว และระดับการฟอกอากาศสามารถเปลี่ยนแปลงได้ ความถี่ของอากาศจะเพิ่มขึ้นตามการเพิ่มขึ้น และเหมาะสำหรับห้องผ่าตัดระดับ 100 ตามมาตรฐาน NASA อย่างไรก็ตาม อัตราความเสียหายของซีลตัวกรองค่อนข้างมาก และต้นทุนค่อนข้างสูง